22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4675 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  39.61 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  38.91 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  36.03 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  31.3 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  33.2 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  34.52 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  34.6 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  41.46 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  38.78 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  37.8 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  33.07 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  33.06 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  32.41 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  30.63 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  43.75 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  55.56 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  35.11 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>