34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1805 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  47.43 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  41.85 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  31.6 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  32.72 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  31.25 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  33.64 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  29.96 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.04 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  29.82 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  29.34 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  26.5 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  26.75 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.74 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.36 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  26.84 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.27 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.07 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  29.81 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  27.57 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  25.33 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  30.11 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  29.33 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.68 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  26.28 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  27.93 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  24.45 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  33.73 
 
 		 310 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>