26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  505  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  29.2 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  28.47 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  31.27 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  28.26 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4079  hypothetical protein  35.17 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.21 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  29.28 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.31 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  27.01 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.1 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  27.86 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.29 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  29.57 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  27.07 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  22.79 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.02 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  25.19 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  24.82 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  23.74 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.93 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  24.21 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  26.17 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  29.92 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.7 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>