27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5480 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  47.73 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  39.29 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  36.73 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.98 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  29.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  32.16 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  32.04 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  29.14 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  33.83 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  29.68 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  31.6 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  30.88 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.89 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  29.72 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  35.21 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.12 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  27.34 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  29.8 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.19 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7277  hypothetical protein  48.84 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40802  normal  0.0842376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>