43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3741 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  100 
 
 		 256 aa  490  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.94 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  31.46 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.32 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30.26 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.04 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.6 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  29.52 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  25.94 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.65 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  28.91 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.49 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.74 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  27.31 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  29.79 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.06 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  27.91 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  30.08 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  30.04 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  31.87 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.56 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 379 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28.76 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.2 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.57 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  31.31 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  35.42 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  35.9 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  33.11 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.43 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  32.91 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  36.05 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  31.87 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  29.23 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.03 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  27.98 
 
 		 260 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>