52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1737 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  33.87 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  29.5 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.52 
 
 		 279 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  29.85 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  31.19 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.45 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.15 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.67 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.19 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.46 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  31.96 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.29 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  29.26 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.9 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.9 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.9 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.85 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  30 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  31.7 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  30.16 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  38.18 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  30.17 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.39 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  27.01 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  24.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  25.09 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  28.84 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.5 
 
 		 750 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  27.65 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  27.91 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  23.46 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  26.51 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  25.89 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  24.62 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.95 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  27.65 
 
 		 297 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  35.51 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  25.82 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.19 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  24.61 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  30.9 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  27.94 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  26.79 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  26.6 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0097  hypothetical protein  40.85 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  24.78 
 
 		 293 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>