65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2174 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  534  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  56.11 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  39.18 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  41.44 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  39.3 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  40.07 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  40.08 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  38.46 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  39.01 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  42.91 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  42.02 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  34.91 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  40.39 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  36.9 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  38.28 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  36.1 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.97 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  37.62 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  33.11 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  34.28 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.19 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  34.72 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  33.96 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  34.3 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.74 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.67 
 
 		 750 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  34.85 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.99 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  33.33 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  32.49 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.68 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.17 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  42.39 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  35.86 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  35.42 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  34.19 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  27.36 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.23 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  31.96 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  36.6 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.03 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  33.99 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  32.82 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  33.33 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  34.57 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.53 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  29.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  31.11 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  32.53 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  32.02 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  26.37 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.6 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.85 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  32 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.18 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.44 
 
 		 518 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  39.05 
 
 		 543 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  28 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>