45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2131 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 288 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  35.11 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  36.5 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  34.36 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  33.05 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  34.04 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.99 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.99 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  29.69 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.32 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  33.82 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  31 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.25 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.2 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.1 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  26.53 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.3 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.04 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.32 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  30.54 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  27.76 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  26.94 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.11 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  36.23 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.16 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  26.47 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  31.09 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.54 
 
 		 750 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  31.43 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  27.21 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.14 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  32.9 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  30.34 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.16 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  28.21 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  30.21 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  24.41 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  27.55 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  32.32 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  33.62 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  35.77 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>