20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4256 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 301 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  31.5 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.69 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  29.71 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  25.91 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  27.01 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  24.44 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30.61 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  34.41 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  29.29 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  28.31 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  27.6 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  30.38 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  23.35 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.81 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  31.2 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  33.94 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  26.87 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  25.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  28.78 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>