50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2235 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  44.57 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  43.95 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  41.06 
 
 		 750 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.5 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  36.26 
 
 		 379 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  33.71 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  30.86 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  31.23 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.65 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  32.33 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.58 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  34.44 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  31.34 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.63 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  28.74 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.31 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  36.07 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.67 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  33.47 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  32.2 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30.65 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.86 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.35 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.69 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.41 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  32.02 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  34.36 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.61 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  30.46 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  34.07 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.5 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.9 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  29.38 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  26.36 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.14 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  32.84 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.35 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  33.96 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.1 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  35.64 
 
 		 518 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  30.48 
 
 		 250 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>