43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1899 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  477  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  49.61 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4807  hypothetical protein  49.57 
 
 		 450 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280649  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 379 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  41.45 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  35.03 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.65 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  34.76 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.28 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  29.53 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.61 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.04 
 
 		 271 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.5 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.55 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.01 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30.41 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.03 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  32.31 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28.98 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.33 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  31.76 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  28.4 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.74 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.53 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.71 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.81 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.2 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.2 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.2 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  31.52 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  30.47 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  29.31 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.86 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  32.14 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  32.05 
 
 		 518 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  27.72 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  30.13 
 
 		 504 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  27.13 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  29.17 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  26.74 
 
 		 246 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>