75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1241 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  56.11 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  43.64 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  41.22 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  39.78 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  41.63 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  39.05 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  39.27 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  40.31 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  43.89 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.33 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  39.25 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  36.3 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  35.02 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  35.46 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  36.07 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.21 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  40 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  35.32 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  32.61 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  35.38 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.68 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  31.68 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  37.36 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  35.32 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.53 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.95 
 
 		 750 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.78 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  35 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.46 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.39 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.87 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.25 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  34.64 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.96 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.96 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.96 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.41 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  36.17 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.84 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  33.71 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  33.18 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.57 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  29.69 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  37.19 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  35.41 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  28.2 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.42 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  36.22 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  36.94 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  25.72 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  24.44 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  29.06 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.71 
 
 		 504 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  29.7 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  24.75 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  40.58 
 
 		 543 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  26.78 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5035  hypothetical protein  27.83 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.13 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  28.62 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  28.25 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  27.65 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  26.7 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  29.37 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  37.39 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  25.47 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  28.02 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28.19 
 
 		 246 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  29.79 
 
 		 281 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>