48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1435 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  100 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.09 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  31.98 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.26 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.14 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.12 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  28.74 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  29.83 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  27.97 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  27.38 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.62 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.07 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  31.21 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  26.67 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.12 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.03 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  37.93 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.97 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  33.48 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.41 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  37.4 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  30.84 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  31.4 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  32.37 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  27.27 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.46 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  34.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  27.91 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.89 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  27.92 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  30.57 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  30.54 
 
 		 504 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3489  putative integral membrane protein  29.5 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  27.97 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.3 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.77 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  25.55 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  29.81 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  29.75 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  33.01 
 
 		 543 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  26.8 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>