56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2845 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  100 
 
 		 287 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  53.09 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  47.95 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  41.34 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  36.92 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  34.12 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  33.16 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.33 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.47 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.2 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  32.04 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  36.18 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.33 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  39.34 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  31.9 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  33.1 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  33 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  33.7 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.17 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.09 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  32.31 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.58 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  31.13 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.84 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  30.22 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.94 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  34.13 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.36 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.93 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.77 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  42.61 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.73 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.01 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.14 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  32.04 
 
 		 750 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  30.24 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  40.38 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.65 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  35.35 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  29.61 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  36.44 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.43 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  28.49 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  24.47 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.25 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.49 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  31.58 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  31.46 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  32.29 
 
 		 504 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  34.62 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.23 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>