45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0312 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  30.49 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.84 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.3 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  33.18 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.95 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  28.63 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.84 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2407  hypothetical protein  41.18 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  31.65 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  31.87 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  32.48 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  29.57 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  27.69 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  30.81 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  30.81 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  30.81 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.93 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  27.97 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  29.82 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  39.47 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  30.81 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.25 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  35.07 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.27 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.78 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  24.87 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.04 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  25.95 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.18 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.46 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0098  hypothetical protein  36.75 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  40.85 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  35.38 
 
 		 750 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  33.88 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.19 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>