40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3689 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  46.76 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  35.41 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  29.68 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.39 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  34.9 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  25.44 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  30.16 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.63 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  23.81 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.54 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  27.44 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  31.75 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  31.75 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  31.75 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  27.15 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  30.19 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.95 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  24.52 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.21 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  28.73 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  36.79 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  38.38 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  27.86 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  33.83 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  27.75 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  27.92 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  27.85 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  26.42 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  29.51 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.79 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  25.88 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  28.92 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  27.04 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  30.36 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.91 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7277  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40802  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  26.44 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>