19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1600 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  96.93 
 
 
261 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  41.83 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  50.82 
 
 
255 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  45.88 
 
 
264 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  37.04 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  36.69 
 
 
265 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  37.02 
 
 
284 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  36.9 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  38.43 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  40.08 
 
 
265 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  38.35 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  39.75 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  36.23 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  33.69 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  34.33 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.13 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>