12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3490 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  31.65 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3489  putative integral membrane protein  28.19 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  25.48 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  25 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  28.31 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  28.57 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  28.97 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  30.2 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  33.64 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  25.3 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>