19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3489 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3489  putative integral membrane protein  100 
 
 		 275 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  28.42 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  32.01 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.92 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  28.69 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  32.46 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  30.22 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  25.22 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  23.46 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  25.29 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  24.4 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  26.33 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  28.09 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.86 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  27.61 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  27.57 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  27.57 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  27.57 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 379 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>