46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  53.21 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  53.12 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  38.33 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.59 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  34.7 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  33.58 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  31.64 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  30.93 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  32.8 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  38.39 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  27.62 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  30.99 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  37.32 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  29.18 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.23 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.9 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  29.73 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.91 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.29 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.35 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  38.92 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  32.41 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  32.22 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.42 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  26.91 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  31.75 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.3 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  30.41 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.57 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.25 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  30.14 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  30 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.88 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.88 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  32.03 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.86 
 
 		 750 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  29.03 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  29.8 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  32.2 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  39.45 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  29.26 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  31.35 
 
 		 251 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>