173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0802 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  100 
 
 
333 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  66.37 
 
 
336 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  66.37 
 
 
336 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  65.96 
 
 
336 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  66.37 
 
 
336 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  66.37 
 
 
336 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  65.36 
 
 
336 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  65.96 
 
 
336 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  65.86 
 
 
336 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  57.46 
 
 
335 aa  338  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  60.52 
 
 
316 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  44.75 
 
 
334 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  41.3 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  40.83 
 
 
328 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  40.62 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  41.1 
 
 
335 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  44.28 
 
 
336 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  41.41 
 
 
333 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  37.8 
 
 
335 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  36.95 
 
 
335 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  41.75 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  40.21 
 
 
338 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  40.98 
 
 
365 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  31.95 
 
 
343 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  31.13 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  30.64 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  30.5 
 
 
336 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  30.5 
 
 
336 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  28.62 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  27.14 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.98 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.12 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.74 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  25.56 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.47 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.55 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.77 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.95 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.44 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.44 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.7 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.03 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.95 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.69 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  29.01 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.35 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.06 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.35 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.44 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.35 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.35 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.12 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.83 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.48 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.22 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.26 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  25.84 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  28.68 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  20 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  25.59 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.06 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  23.03 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  24.31 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  24.84 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.83 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.22 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.49 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1155  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.77 
 
 
320 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0541377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  27.27 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.98 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  26.6 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.42 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.31 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.05 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.24 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.02 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.28 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.19 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.8 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  24.46 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2890  CaCA family transporter: sodium ion/potassium ion/calcium ion  25.14 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29467  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0194  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.84 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.163392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.9 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.55 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.48 
 
 
319 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  28.8 
 
 
359 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  25.61 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.32 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0778  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.62 
 
 
329 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.020554  normal  0.0984265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  31.73 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.24 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0308  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.79 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  30.71 
 
 
359 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.44 
 
 
356 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  31.5 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.58 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.58 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>