39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1978 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 334 aa  644    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  31.69 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.93 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  32.11 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  32.33 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  29.74 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  32.7 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  31.15 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  34.94 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  29.9 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  32.82 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  32.1 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  32.54 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  33.54 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  27.36 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  27.93 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  30.07 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  28.53 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  29.72 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  29.72 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  27.94 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  28.52 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  31.67 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  27.61 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  29.47 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  25.68 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  27.18 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  24.39 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  28.25 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  26.64 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  27.65 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  24.23 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  24.23 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  26.64 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0928  hypothetical protein  22.95 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0958  hypothetical protein  22.95 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  28.15 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.03 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  22.54 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>