88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3053 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 338 aa  647    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  48.41 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  43.37 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  46.95 
 
 		 334 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  41.99 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  43.98 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  45.59 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  40.9 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  43.93 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  43.59 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  43.86 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  41.19 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  39.29 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  42.41 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  40.53 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  40.72 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  40.72 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  42.41 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  38.39 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  38.39 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  38.46 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  42.16 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  40.29 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  40.6 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  40.19 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  40.22 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  40.07 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  32.96 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  31.39 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.92 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.4 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.16 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  25 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  28.72 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  26.79 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.73 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.68 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  27.61 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  25.52 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  28.84 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  27.51 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  27.51 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  21.01 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.67 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.41 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1799  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.9 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  20.65 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4216  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  29.41 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  23.85 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1540  sodium/calcium exchanger membrane region  26.94 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.494574  normal  0.0390081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  27.07 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.65 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  23.86 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.82 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.96 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.51 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  33.33 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.5 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.31 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  26.89 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.5 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.39 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.5 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  33.33 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  24.9 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  35.14 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  25.4 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.55 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  31.4 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.74 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2706  sodium/calcium exchanger membrane region  27.11 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0743  sodium/calcium exchanger membrane region  26.97 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_1885  CaCA family transporter: sodium ion/potassium ion/calcium ion  24.02 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00320098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.2 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  31.87 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  30 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  23.85 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  20.45 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.11 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.39 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.58 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0354  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.88 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.39 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4649  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  29.76 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1267  sodium/calcium exchanger membrane region  23.15 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.53 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0192504  normal  0.0940399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.32 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>