76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1109 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 408 aa  813    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  73.33 
 
 		 406 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  62.78 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  45.6 
 
 		 443 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  45.33 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  49.23 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  43.68 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  51.17 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  44.44 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  38.62 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  37.35 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  37.18 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  36.69 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.6 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.6 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.6 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.6 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.48 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.12 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.56 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.56 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  23.73 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.52 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.52 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.56 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.45 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.52 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.92 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.17 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.53 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.65 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.83 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.01 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.59 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.45 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.89 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.01 
 
 		 319 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4048  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.78 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.242583  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.58 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.86 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.87 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.58 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.39 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  22.59 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.45 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  28.49 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.99 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.64 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.05 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25.2 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.52 
 
 		 296 aa  47  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  22.22 
 
 		 323 aa  47  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  23.69 
 
 		 319 aa  47  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.82 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  25.5 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.41 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  27.46 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.47 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.97 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.53 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  26.42 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.64 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0128  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.29 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573461  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  29.92 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  29.92 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0950  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.18 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.97 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  29.92 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  26.97 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  22.58 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.8 
 
 		 334 aa  43.9  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  27.44 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.62 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  24.34 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  29.13 
 
 		 336 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  29.13 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>