13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  100 
 
 		 452 aa  895    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  65.58 
 
 		 443 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  43.81 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  44.44 
 
 		 408 aa  279  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  49.15 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  39.86 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  38.55 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  37.47 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  37.77 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  43.01 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  38.19 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  40.16 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  36 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>