250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3618 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  100 
 
 
316 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  99.68 
 
 
316 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  98.73 
 
 
316 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  92.72 
 
 
316 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  89.24 
 
 
316 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  87.97 
 
 
314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  87.97 
 
 
314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  87.97 
 
 
314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  87.66 
 
 
314 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  77.74 
 
 
309 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  77.81 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  77.49 
 
 
310 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  78.64 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  74.43 
 
 
307 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  69.45 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  49.37 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  50.16 
 
 
367 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  49.84 
 
 
369 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  47.15 
 
 
357 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  49.84 
 
 
367 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.28 
 
 
357 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.18 
 
 
312 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.23 
 
 
358 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.15 
 
 
357 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.45 
 
 
368 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  47.6 
 
 
358 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  43.57 
 
 
326 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.73 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  49.67 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0608  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  50.55 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  48.87 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.87 
 
 
314 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  43.96 
 
 
322 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.76 
 
 
326 aa  229  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.11 
 
 
350 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.23 
 
 
322 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.18 
 
 
360 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  43.69 
 
 
332 aa  225  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.18 
 
 
305 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.68 
 
 
322 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  41.32 
 
 
323 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.85 
 
 
334 aa  221  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.45 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.75 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.15 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  43.33 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.15 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3171  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  46.13 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.71951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  45.15 
 
 
305 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.75 
 
 
343 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.78 
 
 
323 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  43.14 
 
 
321 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  46.05 
 
 
353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.72 
 
 
325 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  45.79 
 
 
318 aa  215  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  44.23 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  40.32 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.92 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0905  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.07 
 
 
354 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  42.48 
 
 
312 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.49 
 
 
325 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.89 
 
 
323 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.13 
 
 
320 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.19 
 
 
321 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.92 
 
 
304 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.51 
 
 
311 aa  209  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  44.04 
 
 
320 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  44.52 
 
 
321 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  41.43 
 
 
360 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.62 
 
 
325 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1742  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.33 
 
 
325 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0365853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  42.26 
 
 
325 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.01 
 
 
320 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.97 
 
 
324 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.69 
 
 
325 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.49 
 
 
319 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.22 
 
 
319 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.52 
 
 
314 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.87 
 
 
314 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.52 
 
 
321 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  42.58 
 
 
359 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.47 
 
 
320 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.79 
 
 
343 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.08 
 
 
365 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.12 
 
 
319 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.52 
 
 
324 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.52 
 
 
324 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.52 
 
 
324 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.66 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.48 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  37.69 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  39.87 
 
 
318 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.46 
 
 
324 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.09 
 
 
319 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.76 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  40.91 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  40.58 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.28 
 
 
435 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.24 
 
 
296 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  39.8 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>