15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0637 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
397 aa  770    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  49.86 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  50.43 
 
 
406 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  48.85 
 
 
412 aa  302  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  48.43 
 
 
440 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  47.99 
 
 
452 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  45.36 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  50.31 
 
 
428 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  47.56 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  38.14 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  37.25 
 
 
452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  38.7 
 
 
436 aa  212  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  39.1 
 
 
448 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  34.78 
 
 
322 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  27.64 
 
 
335 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>