65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0106 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  32.57 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  30.07 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  31.45 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.8 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  31.45 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  31.45 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  30.99 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  28.05 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  29.9 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  31.29 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  30.74 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  28.16 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  29.93 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  30.54 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  29.08 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  29.82 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  30.37 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  29.33 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  30.48 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  30 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  32.84 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  28.15 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  31.73 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  28.81 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  28.81 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  30.45 
 
 		 365 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  25.88 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  25.98 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.04 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25.57 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.28 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.66 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.63 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.61 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.94 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  27.21 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  30.45 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  24.81 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2706  sodium/calcium exchanger membrane region  22.39 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  20.6 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  23.69 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  28.36 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  23.87 
 
 		 369 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.67 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  26.19 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.19 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.4 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  27.6 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.27 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.27 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.29 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.34 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.6 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.35 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.17 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.88 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  30.16 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.11 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0928  hypothetical protein  24.89 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0804  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.05 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.44 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0958  hypothetical protein  25.45 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  26.07 
 
 		 364 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>