76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2541 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 336 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  95.83 
 
 		 336 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  95.83 
 
 		 336 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  53.41 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  38.84 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  37.54 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  35.08 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  35.09 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  39.78 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  39.04 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  34.78 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  32.41 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  35.08 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  35.58 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  32.73 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  35.96 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  33.55 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  33.68 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  33.68 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.67 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  33.67 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  34.55 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  29.9 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  31.49 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  32.73 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  33.01 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  32.36 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  31.54 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  24.04 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.38 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  26.1 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.2 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.66 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  23.24 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.37 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  23.91 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.91 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.31 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.57 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.76 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.57 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.93 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  30.35 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.12 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  26.52 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  25 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4216  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.89 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.91 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  24.35 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0321  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.81 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.005086 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.76 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.72 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.31 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1267  sodium/calcium exchanger membrane region  19.86 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.84 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  30.3 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1155  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.71 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0541377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.33 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  25.64 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.18 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0804  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  20.55 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.32 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  22.62 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  25.56 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4649  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.6 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  25.18 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  24.23 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.59 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.18 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  27.81 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.8 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.43 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.32 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>