70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0488 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  56.87 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  57.05 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  59.22 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  57.51 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  30.7 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  23.94 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  25.77 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  23.86 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  24.01 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  24.4 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  24.76 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  22.83 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  22.83 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.8 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  22.55 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.66 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  23.55 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  22.04 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  23.66 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.47 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.23 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.23 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.23 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  22.87 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.59 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.34 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  24.8 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.32 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.74 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.56 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.19 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  20.69 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  22.59 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.83 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0950  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  20.38 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  23.24 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  22.88 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.25 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.23 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.39 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  24.35 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  24.19 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.81 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  26.25 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.77 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.75 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0163  putative K+-dependent Na+/Ca+ exchanger homolog  27.87 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.66 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1742  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.53 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0365853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.53 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.14 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.38 
 
 		 364 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  23.76 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.12 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.91 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1207  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.83 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  22.55 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.89 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  36.62 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  36.62 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.73 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.73 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.7 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  21.66 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  29.27 
 
 		 452 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.63 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.37 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>