248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0732 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  100 
 
 
319 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  88.71 
 
 
319 aa  564  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  88.4 
 
 
319 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  84.33 
 
 
319 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  79.62 
 
 
320 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  77.29 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  74.76 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  58.14 
 
 
320 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  54.8 
 
 
326 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  53.31 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  54.11 
 
 
332 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  53.27 
 
 
321 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  52.32 
 
 
322 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  53.59 
 
 
321 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  48.28 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  46.23 
 
 
324 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  46.23 
 
 
324 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  46.23 
 
 
324 aa  262  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  45.31 
 
 
321 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  45 
 
 
321 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.94 
 
 
323 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.02 
 
 
325 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  45.39 
 
 
320 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  45.17 
 
 
320 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.65 
 
 
326 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  43.53 
 
 
326 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  45.37 
 
 
331 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.72 
 
 
323 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.05 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.73 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.52 
 
 
324 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  45.99 
 
 
323 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.27 
 
 
324 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.71 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.03 
 
 
324 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.59 
 
 
325 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.73 
 
 
321 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.72 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  42.9 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0181  sodium/calcium antiporter family protein  41.19 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  41.19 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.14 
 
 
364 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.41 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.88 
 
 
325 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.88 
 
 
325 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.56 
 
 
325 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.31 
 
 
329 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.56 
 
 
325 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.56 
 
 
325 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.09 
 
 
316 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.73 
 
 
367 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.27 
 
 
357 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.29 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.09 
 
 
316 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.32 
 
 
316 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.09 
 
 
316 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.92 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.1 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.44 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.69 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.69 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.69 
 
 
325 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.44 
 
 
314 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.44 
 
 
314 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.69 
 
 
325 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.69 
 
 
325 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.12 
 
 
314 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.34 
 
 
367 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.98 
 
 
325 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.81 
 
 
307 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  41.37 
 
 
325 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  41.37 
 
 
325 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.22 
 
 
369 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  44.31 
 
 
316 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.66 
 
 
325 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.45 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.03 
 
 
310 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.66 
 
 
357 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.61 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.77 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.24 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.5 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.38 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.22 
 
 
305 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.06 
 
 
350 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.15 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.29 
 
 
367 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  36.22 
 
 
331 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.44 
 
 
321 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  36.22 
 
 
305 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.01 
 
 
315 aa  175  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.2 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.54 
 
 
368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  38.51 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  38.24 
 
 
361 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.65 
 
 
325 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  34.81 
 
 
320 aa  168  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  34.49 
 
 
322 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.67 
 
 
304 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.98 
 
 
310 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>