177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4112 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  99.4 
 
 
336 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  99.4 
 
 
336 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
336 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  93.45 
 
 
336 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  89.88 
 
 
336 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  89.29 
 
 
336 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  75.3 
 
 
336 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  74.7 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  67.19 
 
 
333 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  61.71 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  65.31 
 
 
316 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  44.88 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  43.03 
 
 
332 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  42.9 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  40.18 
 
 
332 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  40.46 
 
 
333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  40.3 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  38.15 
 
 
335 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  37.43 
 
 
335 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  42.44 
 
 
336 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  43.01 
 
 
330 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  43.06 
 
 
338 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  44.1 
 
 
365 aa  179  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  33.55 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  33.24 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  31.45 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  33.55 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  33.55 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  30.47 
 
 
334 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.59 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.54 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.97 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.2 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.2 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.74 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.18 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.03 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  24.28 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.56 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.48 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.81 
 
 
332 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.37 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  26.32 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.34 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.62 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.23 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  22.55 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.8 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.28 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.92 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  24.04 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  29.46 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  31.58 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.97 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  24.1 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.17 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.43 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.18 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  26.79 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.79 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.82 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  27.68 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  24.29 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.52 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  25.58 
 
 
462 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.94 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.06 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  27.42 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.36 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  28.16 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  32.29 
 
 
322 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.16 
 
 
356 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.43 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2409  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.82 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0267872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.99 
 
 
320 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1155  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.91 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0541377  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  22.91 
 
 
323 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.57 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.78 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  32.26 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  23.84 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0308  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.75 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  32.48 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.35 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1218  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.31 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.46 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  23.4 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.81 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  26.74 
 
 
448 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.51 
 
 
360 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  27.41 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  27.41 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  27.41 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  30.37 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0192504  normal  0.0940399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>