105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1664 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
336 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
336 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  95.83 
 
 
336 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  52.23 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  38.62 
 
 
334 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  38.53 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  35.08 
 
 
335 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  40.37 
 
 
336 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  34.47 
 
 
335 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  39.34 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  34.78 
 
 
333 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  32 
 
 
335 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  36.94 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  35.69 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  33.64 
 
 
332 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  35.62 
 
 
365 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 
336 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  33.45 
 
 
336 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  33.45 
 
 
336 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.23 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  32.9 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  32.9 
 
 
336 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  32.73 
 
 
333 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  30.61 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  32.69 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  33.66 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  32.86 
 
 
316 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  23.69 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.75 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.94 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  26.06 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  23.18 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.9 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.14 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.85 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.59 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.72 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.72 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.31 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.27 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1155  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.64 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0541377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.22 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.31 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.62 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  24.61 
 
 
323 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  28.4 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.6 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  23.7 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.2 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.47 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  26.34 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0321  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.9 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.005086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.15 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.61 
 
 
330 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1267  sodium/calcium exchanger membrane region  22.36 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.64 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.91 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.77 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  24.46 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.02 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.97 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.24 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4216  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.6 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  30.6 
 
 
334 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  24.62 
 
 
360 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.19 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0804  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  20.55 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.13 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.6 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  24.91 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  28.04 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4649  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  26.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.02 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  20.69 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  24.63 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  22.88 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.71 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  23.95 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.64 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.46 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.47 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.81 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.94 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.24 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  23.36 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  23.83 
 
 
331 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.18 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0391  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.36 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.44 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.43 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.74 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>