106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2086 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
335 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  52.55 
 
 
332 aa  341  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  50.3 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  49.7 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  48.47 
 
 
328 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  47.71 
 
 
332 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  45.45 
 
 
335 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  48.08 
 
 
336 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  42.37 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  40.54 
 
 
333 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  40.29 
 
 
330 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  38.18 
 
 
336 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  38.67 
 
 
336 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  37.88 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  37.88 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  37.58 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  37.81 
 
 
335 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  38.37 
 
 
336 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  38.26 
 
 
336 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  38.52 
 
 
333 aa  185  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  32.75 
 
 
336 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  40.22 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  37.69 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  31.87 
 
 
336 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  31.87 
 
 
336 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 
365 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  30.41 
 
 
343 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  30.07 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  29.25 
 
 
334 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  26.97 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.61 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  25.42 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.14 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  22.97 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  25.37 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.17 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25.18 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  24.91 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.48 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25 
 
 
364 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  25.1 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  22.96 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4032  sodium/calcium exchanger membrane region  24.84 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.51 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.51 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.51 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.81 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  23.19 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.16 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.79 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.08 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  27.08 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.13 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.5 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.96 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  20.8 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.93 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.62 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.73 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1155  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.08 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0541377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.99 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.09 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  21.09 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.98 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.34 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.36 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0194  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.11 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.163392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.74 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.53 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  23.14 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.74 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  21.49 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  22.99 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  22.05 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.66 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.24 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  22.79 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1267  sodium/calcium exchanger membrane region  22.79 
 
 
363 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.05 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.22 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0391  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.36 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.28 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.02 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.5 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  23.72 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.07 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  28.05 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.11 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.26 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0354  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2890  CaCA family transporter: sodium ion/potassium ion/calcium ion  26.75 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29467  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  31.82 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.93 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.26 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>