73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1216 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 326 aa  629  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  72.31 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  74.92 
 
 		 323 aa  461  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  72.19 
 
 		 343 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  59.22 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  34.38 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  25.78 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  27.45 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  24.91 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.98 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  25.17 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  23.41 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  25.36 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  27.24 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  25.46 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  25.46 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  25.46 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  29.66 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  27.49 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  24.91 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.87 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  25.18 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  24.51 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.65 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.92 
 
 		 435 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  28.85 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.94 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.32 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  24.91 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.34 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.83 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1218  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.72 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  25.1 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  25.42 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  26.8 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.66 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.11 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.32 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.05 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.83 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  28.26 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  25.78 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.68 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.35 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.64 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.76 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.76 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  28.11 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.88 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.3 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.76 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.19 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  22.82 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  25.23 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.4 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.15 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.4 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.3 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  24.46 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.64 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  31.88 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  29.02 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  26.13 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  26.13 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  25.34 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  20.74 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  21.72 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.14 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  22.93 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>