158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1471 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
330 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  49.38 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  51.23 
 
 
334 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  46.77 
 
 
328 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  47.85 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  45.58 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  41.67 
 
 
333 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  41.41 
 
 
332 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  38.12 
 
 
335 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  38.58 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  42.51 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  42.22 
 
 
336 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  42.38 
 
 
338 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  42.51 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  41.8 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  40.98 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  40.98 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  40.98 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  42.47 
 
 
335 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  44.03 
 
 
316 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  42.38 
 
 
333 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  41.78 
 
 
336 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  34.14 
 
 
336 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  40.84 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  35.51 
 
 
336 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  35.51 
 
 
336 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  34.51 
 
 
343 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  29.82 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  26.37 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.42 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.2 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.42 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.54 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.47 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.08 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.62 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.62 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.84 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.53 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.61 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.53 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.53 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.53 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.43 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.62 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.62 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.36 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  25.83 
 
 
364 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.06 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.46 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.76 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.76 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.15 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  24.44 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.44 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  27.86 
 
 
343 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.97 
 
 
322 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.8 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.88 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  28.52 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.17 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.94 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  24.33 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  26.33 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  24.03 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.96 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.33 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.8 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  25.53 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.22 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  25.53 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.81 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.92 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.29 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.2 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.2 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.2 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.13 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.96 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.6 
 
 
309 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.46 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.53 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.53 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.11 
 
 
325 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.27 
 
 
353 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.46 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.59 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  21.61 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  27.17 
 
 
323 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.06 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>