244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0004 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  100 
 
 
364 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  98.35 
 
 
364 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  67.31 
 
 
360 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  65.29 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  61.6 
 
 
361 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  60 
 
 
359 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  58.69 
 
 
359 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  59.69 
 
 
359 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  59.08 
 
 
359 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0984  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  61.62 
 
 
361 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.233061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.62 
 
 
367 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.5 
 
 
364 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.5 
 
 
358 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.51 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.72 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.16 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.35 
 
 
310 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.91 
 
 
367 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.07 
 
 
368 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.21 
 
 
310 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.45 
 
 
357 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  40.91 
 
 
309 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.75 
 
 
314 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.75 
 
 
314 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  41.86 
 
 
361 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.75 
 
 
314 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.4 
 
 
358 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.1 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.23 
 
 
316 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  41.23 
 
 
316 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.91 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.61 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.91 
 
 
316 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.91 
 
 
316 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.29 
 
 
307 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.57 
 
 
357 aa  192  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.85 
 
 
310 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.62 
 
 
314 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  40.6 
 
 
353 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.62 
 
 
319 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.96 
 
 
360 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.89 
 
 
312 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.66 
 
 
326 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.13 
 
 
435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  35.58 
 
 
331 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  35.83 
 
 
325 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.94 
 
 
305 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  38.05 
 
 
323 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  37.42 
 
 
305 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.34 
 
 
314 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.26 
 
 
323 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.15 
 
 
324 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.18 
 
 
324 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  34.98 
 
 
321 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.04 
 
 
350 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  36.42 
 
 
322 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  34.65 
 
 
321 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.92 
 
 
310 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  36.51 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  36.51 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  36.51 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.16 
 
 
324 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  36.6 
 
 
312 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.46 
 
 
321 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.08 
 
 
331 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.16 
 
 
324 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  40.19 
 
 
320 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.34 
 
 
325 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.65 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.95 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.79 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.2 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  36.08 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.41 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.5 
 
 
328 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.09 
 
 
320 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.11 
 
 
316 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2409  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.54 
 
 
339 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0267872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  35.47 
 
 
326 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.5 
 
 
325 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.02 
 
 
325 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.74 
 
 
317 aa  159  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.14 
 
 
322 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.58 
 
 
334 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.58 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.58 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  35.69 
 
 
332 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.33 
 
 
311 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.33 
 
 
321 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0608  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.09 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  34.32 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  33.66 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4048  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.79 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.242583  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.53 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.16 
 
 
324 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.78 
 
 
329 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.42 
 
 
365 aa  155  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.1 
 
 
343 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.61 
 
 
320 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  37.25 
 
 
322 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>