46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0127 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  94.77 
 
 		 343 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  83.39 
 
 		 323 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  72.31 
 
 		 326 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  57.05 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  33.58 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  28.13 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  27.85 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  25.09 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  27.2 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  27.02 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  24.06 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  23.62 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  21.99 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.06 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  24.12 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.89 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  28.57 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  28.09 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1218  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.47 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  26.17 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.08 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.41 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.47 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  32.43 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  32.43 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  32.43 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.36 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.53 
 
 		 357 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  30 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.44 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.87 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  28 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  24.28 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  24.77 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  23.62 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.32 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0903  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.27 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301766  normal  0.251972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  25.56 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  23.47 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.13 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.84 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.21 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.41 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>