121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0486 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  100 
 
 
358 aa  693    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  78.77 
 
 
356 aa  471  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  47.99 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.48 
 
 
365 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  49.59 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.21 
 
 
365 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  51.69 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  50.83 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  46.81 
 
 
370 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  47.99 
 
 
348 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  48.92 
 
 
364 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.94 
 
 
354 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  52.3 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.02 
 
 
367 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  43.84 
 
 
354 aa  285  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.58 
 
 
358 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  42.11 
 
 
416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.78 
 
 
363 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  48.24 
 
 
374 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.25 
 
 
350 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  49.16 
 
 
388 aa  262  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.92 
 
 
351 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  44.48 
 
 
354 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  44.48 
 
 
354 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  44.48 
 
 
354 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  44.48 
 
 
354 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  44.2 
 
 
354 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  44.93 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  44.64 
 
 
351 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  44.35 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  44.64 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  46.02 
 
 
354 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  48.39 
 
 
331 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  40.49 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.96 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  44.35 
 
 
351 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  44.35 
 
 
351 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  41.67 
 
 
348 aa  239  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.72 
 
 
349 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  37.34 
 
 
544 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.48 
 
 
356 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  41.53 
 
 
367 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.11 
 
 
366 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  42.37 
 
 
381 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  41.37 
 
 
361 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  43.11 
 
 
370 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.82 
 
 
364 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  39.95 
 
 
403 aa  205  9e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  34.26 
 
 
324 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  35.65 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  51.47 
 
 
689 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.09 
 
 
742 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  44.68 
 
 
599 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  30.67 
 
 
481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  26.16 
 
 
967 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  55.63 
 
 
189 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  30 
 
 
1129 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 
1344 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  22.37 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.55 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.37 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  26.7 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  26.19 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  27.27 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  27.27 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  26 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  30.77 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  25.19 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  26.87 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  27.49 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  26.87 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  26.87 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  26.48 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  23.99 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  26.49 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  24.4 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  26.49 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  26.49 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.3 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  27.52 
 
 
392 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0778  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.75 
 
 
329 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.020554  normal  0.0984265 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  26.02 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  26.3 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  24.76 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  26.2 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.33 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.23 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  21.75 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.5 
 
 
311 aa  49.7  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  25.9 
 
 
360 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  25.9 
 
 
360 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  24.89 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  23.17 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  22.74 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.22 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.03 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  21.94 
 
 
365 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>