101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11387 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  100 
 
 
348 aa  698    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  45.89 
 
 
416 aa  311  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  44.48 
 
 
434 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.25 
 
 
544 aa  275  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.13 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.48 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.95 
 
 
367 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  40.92 
 
 
363 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  39.88 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  36.21 
 
 
370 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  38.98 
 
 
364 aa  226  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  39.44 
 
 
372 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  38.29 
 
 
403 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.39 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  35.1 
 
 
348 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  38.51 
 
 
360 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.01 
 
 
351 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.67 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  35.28 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  36.81 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  34.51 
 
 
348 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  35.99 
 
 
354 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  33.33 
 
 
349 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.77 
 
 
356 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.31 
 
 
379 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  36.77 
 
 
363 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  35.88 
 
 
350 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  34.4 
 
 
354 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  33.85 
 
 
324 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  34.4 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  34.4 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  34.4 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  34.4 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  34.4 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  34.88 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  34.11 
 
 
351 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  34.11 
 
 
354 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  34.4 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  35.88 
 
 
350 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  35.44 
 
 
356 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  33.64 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  34.11 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  33.95 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  37.02 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  35.29 
 
 
331 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  32.24 
 
 
381 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  32.54 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  31.48 
 
 
361 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  31.7 
 
 
481 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  46.48 
 
 
599 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  34.73 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  43.24 
 
 
742 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  46.58 
 
 
689 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  31.21 
 
 
365 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  23.28 
 
 
967 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  29.13 
 
 
1129 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
1344 aa  73.6  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  40 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  23.05 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  23.59 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  23.6 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  22.73 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  26.98 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  25.2 
 
 
361 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  25.2 
 
 
361 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  25.11 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  25.2 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  20 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  21.09 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  24.8 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  24.8 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  24.8 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  26.6 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  20.94 
 
 
367 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  25.26 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  25.26 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  22.62 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  25.26 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  21.81 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  21.81 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  20.59 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.99 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  23.48 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  25.64 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  26.67 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  21.12 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.36 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  23.11 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.52 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.76 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.81 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  24.69 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  21.71 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  24.92 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  21.97 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.23 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  22.13 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.98 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  21.8 
 
 
369 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  19.18 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>