136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0894 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  100 
 
 		 367 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  70.64 
 
 		 364 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  62.43 
 
 		 381 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  42.15 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.71 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.44 
 
 		 365 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.33 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  42.73 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  41.34 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  43.18 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  41.14 
 
 		 364 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  39.88 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.16 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.63 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  41.9 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.26 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  37.26 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  34.52 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.75 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.96 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  41.33 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  40.24 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.94 
 
 		 351 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.69 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  38.55 
 
 		 354 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  39.22 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  34.42 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.36 
 
 		 356 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.53 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  38.86 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  38.55 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  32.46 
 
 		 544 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  38.75 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  34.93 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  38.98 
 
 		 374 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  33.64 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  36.57 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.61 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  32.48 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.12 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  32.73 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  37.28 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  32.75 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  40.28 
 
 		 742 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  33.76 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  36.74 
 
 		 689 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  29.05 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  24.5 
 
 		 967 aa  97.4  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  43.33 
 
 		 599 aa  96.3  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  26.59 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  26.06 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  44.2 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  23.96 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  29.65 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  29.23 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  27.27 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  28.74 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 		 1344 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  27.62 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  27.84 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  25.81 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  26.98 
 
 		 1129 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  27.41 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  24.1 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  24.36 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  28.3 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  28.3 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  28.3 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  28.47 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  28.47 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  28.47 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  28.3 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  26.94 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  28 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  26.18 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  26.94 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  26.18 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  26.69 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  24.61 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  27.92 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  27.57 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  26.57 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  28.28 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  28.28 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  28.28 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  26.57 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  28.28 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  27.57 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>