105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1001 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  100 
 
 		 365 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  96.16 
 
 		 365 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  94.25 
 
 		 370 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  94.52 
 
 		 365 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  93.91 
 
 		 361 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  94.18 
 
 		 361 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  94.52 
 
 		 365 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  47.88 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  47.13 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  47.69 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  43.96 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  47.46 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  47.46 
 
 		 366 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  45.92 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  45.92 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  45.92 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  47.06 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  47.16 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  47.16 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  48 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  43.82 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  45.96 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  45.65 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  45.48 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  45.06 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  39.83 
 
 		 368 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  39.24 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  40.06 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  42.33 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  39.93 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  41.61 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  42.34 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  40 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  40 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  41.04 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  41.61 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  41.61 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  41.29 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  41.29 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  38.06 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  39.37 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  40.65 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  40.63 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  40.45 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  40.45 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  40.45 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  40.45 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  40.45 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  40.45 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  37.14 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  40.13 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  38.34 
 
 		 386 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  41.61 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  37.82 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  39.24 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  40.14 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  32.15 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  36.54 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  41.08 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  35.17 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  39.56 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.23 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  40.26 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  38.28 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  35.74 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  42.12 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  38.46 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  41.49 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  30.68 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  34.77 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  38.92 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  31.68 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  31.12 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  31.72 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  32.74 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  34.59 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  31.45 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  36.04 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  29.65 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.77 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.43 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.43 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.86 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  26.95 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.49 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  23.72 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.48 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  22.62 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  22.27 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  21.21 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  22.43 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  22.18 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>