106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0959 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  93.91 
 
 		 365 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  95.84 
 
 		 365 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  98.61 
 
 		 370 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  97.23 
 
 		 365 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 361 aa  714    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  99.45 
 
 		 361 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  98.89 
 
 		 365 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  48.64 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  48.31 
 
 		 366 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  47.43 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  47.13 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  46.91 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  46.91 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  46.91 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  47.68 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  47.89 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  47.89 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  44.2 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  47.59 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  47.59 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  46.77 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  44.38 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  46.44 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  46.44 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  45.85 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  45.37 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  43.92 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  40.34 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  39.6 
 
 		 360 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  41.48 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  40.63 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  40.65 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  40.65 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  40.65 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  40.65 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  39.03 
 
 		 385 aa  205  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  40.32 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  40.18 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  38.98 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  39.68 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  39.68 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  40.51 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  39.68 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  37.9 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  40 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  39.81 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  39.81 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  39.81 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  39.81 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  39.81 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  39.81 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  39.18 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  39.49 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  40.65 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  39.79 
 
 		 360 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  33.07 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  36.51 
 
 		 358 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  32.1 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  35.37 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  39.1 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  39.24 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  40.38 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  39.81 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  33.33 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  37.75 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  35.58 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  40.19 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.42 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  33.44 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  40.18 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  34.71 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  31.78 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  38.61 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  31.52 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  32.17 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  34.79 
 
 		 440 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  32.33 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  34.95 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  31.27 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  27.62 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.43 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.43 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  25.08 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.12 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  23.14 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  24.7 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  25.2 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  23.53 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.32 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  22.36 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  21.74 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  20.83 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  23.53 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>