129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0140 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 374 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  71.63 
 
 		 365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  70.96 
 
 		 367 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  70.52 
 
 		 363 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  67.01 
 
 		 385 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  73.53 
 
 		 365 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  73.26 
 
 		 365 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  32.63 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  32.33 
 
 		 365 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  33.61 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  33.88 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  32.02 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  32.33 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  32.02 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  31.72 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  32.02 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  36.39 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  33.12 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  34.71 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  33.12 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  31.55 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  33.12 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  32.79 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  32.79 
 
 		 362 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  32.79 
 
 		 362 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  32.79 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  32.79 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  33.44 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  32.91 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  33.65 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  32.91 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  32.91 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  32.91 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  32.59 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  34.08 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  33.33 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  31.41 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  31.41 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  31.41 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  32.79 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  32.91 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  32.14 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  32.8 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  32.8 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  32.8 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  31.13 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  31.33 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  33.12 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  31.78 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  32.19 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  32.27 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  32.27 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  32.27 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  32.19 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  32.19 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  32.28 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  32.71 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  31.95 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  31.15 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  33.7 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  32.47 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  31.64 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  31.12 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  32.17 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  33.81 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  31.56 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  29.45 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  29.02 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  28.01 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  34.52 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  30.63 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  28.71 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  28.2 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  28.5 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.25 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  29.97 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  31.47 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  31.66 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  27.43 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  28.89 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.94 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  28.75 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  26.77 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.91 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.27 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  25.09 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  23.42 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.13 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.13 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  25.93 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  24.72 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  25.43 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.4 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  25.61 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>