129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4970 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 360 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  93.89 
 
 		 360 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  75.78 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  75.5 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  75.78 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  75.5 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  75.5 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  75.78 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  75.5 
 
 		 380 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  74.37 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  75 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  73.37 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  72.24 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  73.37 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  72.24 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  73.3 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  72.8 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  73.3 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  79.89 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  73.86 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  68.36 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  72.03 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  59.62 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  62.76 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  65.19 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  58.94 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  63.66 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  63.06 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  58.54 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  58.88 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  54.55 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  54.63 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  46.18 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  52.77 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  45.22 
 
 		 358 aa  309  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  49.25 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  56.04 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  47.88 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  52.63 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  56.78 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  46.18 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  43.61 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  43.49 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  41.67 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  42.99 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  42.86 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  40.43 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  40.12 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  40.12 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  40.12 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  39.2 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  38.14 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  39.81 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  39.51 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  38.29 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  38.29 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  38.29 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  37.57 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  37.08 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  36.78 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  36.78 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  36.78 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  36.45 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  36.47 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  36.45 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  36.12 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  36.36 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  36.12 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  36.12 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  35.82 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  34.34 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  34.13 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.9 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  37.96 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  42.35 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  32.32 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  32.7 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  32.02 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  32.8 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  35.06 
 
 		 440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  25.88 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  27.52 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  25.48 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  24.75 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.77 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  28.93 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.3 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  27.46 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  22.13 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  38.21 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.42 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  25.7 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  27.53 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  26.22 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>