122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5192 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  100 
 
 		 381 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  66.48 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  62.43 
 
 		 367 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.25 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.25 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.98 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  40.99 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  40.7 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  41.86 
 
 		 348 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  42.9 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.65 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.38 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  41.62 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  40.76 
 
 		 364 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  36.92 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.59 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  41.55 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  35.53 
 
 		 434 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.54 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.4 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  38.95 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  43.9 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.37 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  40.78 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  39.16 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  38.6 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  38.91 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  38.91 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  39.42 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  38.6 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  38.6 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  38.6 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  38.18 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.74 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  39.21 
 
 		 351 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  39.16 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.04 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  32.96 
 
 		 544 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.53 
 
 		 350 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  33.54 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  37.6 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.09 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  37.87 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  32.24 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.6 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  35.5 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  38.3 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  31.52 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  29.32 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  33.11 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228892 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.41 
 
 		 742 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  35 
 
 		 689 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  35.42 
 
 		 599 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  23.75 
 
 		 967 aa  90.1  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  41.14 
 
 		 189 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  26.76 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.61 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  25.4 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.08 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 1344 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  27.31 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  28.29 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  24.84 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  23.9 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  24.53 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  31.62 
 
 		 1129 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  27.34 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  28.35 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  25.76 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  25.45 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  28.44 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  27.69 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  27.69 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  23.76 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  24.92 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  29.59 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  29.59 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  30.15 
 
 		 362 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  30.71 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  27.36 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  30.71 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  30.71 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  29.05 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  28.75 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  29.05 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  28.75 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  28.75 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  29.05 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  24.6 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  29.21 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  24.42 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  24.52 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  28.63 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  24.51 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  25.75 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  22.54 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  24.71 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  28.9 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  29.7 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  23.75 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>