129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0142 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  100 
 
 		 360 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  51.45 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  51.45 
 
 		 348 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  47.7 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  49.72 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  49.72 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  50.14 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  47.22 
 
 		 370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  50.57 
 
 		 363 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  53.04 
 
 		 379 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  49.72 
 
 		 364 aa  298  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.43 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  51.13 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.3 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.31 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.64 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  42.09 
 
 		 416 aa  275  7e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.73 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  50.42 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.13 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  46.86 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  45.79 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  42.9 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.51 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  46.24 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  46.53 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  46.53 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  46.24 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  46.24 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  45 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  46.53 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  45.95 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  45.95 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  48.21 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  45.35 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  44.51 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  46.82 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.11 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  41.9 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.25 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.98 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.29 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  38.62 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  41.55 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  43.65 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  40.36 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  34.34 
 
 		 544 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  38.29 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  33.12 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  37.94 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  40.4 
 
 		 689 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  29.86 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  40.1 
 
 		 742 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  51.43 
 
 		 189 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  38.51 
 
 		 599 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  30.15 
 
 		 1129 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 1344 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 967 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  26.12 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  29.62 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  29.62 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.15 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  29.46 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  29.23 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  28.79 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  28.79 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  28.68 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.88 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  22.63 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  24.58 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  24.9 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  27.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  27.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  27.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  27.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  26.88 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  26.67 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  26.67 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  26.67 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.8 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  24.31 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  26.85 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  22.62 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  26.69 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  21.96 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  28.91 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  25 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  21.74 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  22.13 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  21.91 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.57 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  26.6 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.05 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.14 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  21.91 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  27.05 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  29.48 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.23 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.72 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  26.4 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>