99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3511 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  91.25 
 
 
377 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
377 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  54.78 
 
 
368 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  48 
 
 
365 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  46.77 
 
 
365 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  46.77 
 
 
361 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  46.77 
 
 
361 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  46.27 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  46.46 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  46.46 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  45.25 
 
 
365 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  45.71 
 
 
378 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  45.13 
 
 
380 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  43.73 
 
 
386 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  40.19 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  40.19 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  41.07 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  41.07 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  41.07 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
366 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
366 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  40.81 
 
 
366 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
364 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  41.05 
 
 
366 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  39.38 
 
 
366 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  39.06 
 
 
366 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  39.06 
 
 
366 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  44.76 
 
 
368 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  38.32 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  42.22 
 
 
360 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  40.75 
 
 
366 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  42.11 
 
 
369 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  44.23 
 
 
361 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  44.23 
 
 
361 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  44.23 
 
 
380 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  44.23 
 
 
361 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  44.23 
 
 
361 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  44.23 
 
 
361 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  43.91 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  43.55 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  43.97 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  42.12 
 
 
362 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  43.32 
 
 
362 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  43.32 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  41.9 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  41.9 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  43.3 
 
 
355 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  34.29 
 
 
358 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  35.48 
 
 
382 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  37.74 
 
 
360 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  35.74 
 
 
382 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  38.51 
 
 
392 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  37.54 
 
 
359 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  43 
 
 
362 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  37.78 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  39.16 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  39.16 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  33.24 
 
 
367 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  37.35 
 
 
371 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  44.62 
 
 
359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  40.82 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  34.82 
 
 
343 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  41.19 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  38.97 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  32.24 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  32.62 
 
 
385 aa  173  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  32.83 
 
 
363 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  38.37 
 
 
361 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  43.57 
 
 
361 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  42.27 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  34.27 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  32.14 
 
 
365 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  40.06 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  35.65 
 
 
374 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  29.35 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  34.47 
 
 
365 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  34.56 
 
 
440 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.54 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  23.26 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  23.2 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  25.3 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  21.94 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  24.51 
 
 
381 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  19.69 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  21.64 
 
 
1129 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  20.99 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  25.41 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  22.75 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.42 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  20 
 
 
348 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>