103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4437 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  100 
 
 
355 aa  687    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  61.97 
 
 
392 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  66.2 
 
 
361 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  61.97 
 
 
360 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  61.97 
 
 
360 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  60.8 
 
 
380 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  60.8 
 
 
361 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  60.8 
 
 
361 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  60.8 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  60.8 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  60.8 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  69.94 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  61.47 
 
 
381 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  62.82 
 
 
360 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  60.51 
 
 
361 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  65.96 
 
 
361 aa  355  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  59.49 
 
 
362 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  59.21 
 
 
362 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  59.21 
 
 
362 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  59.66 
 
 
362 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  59.66 
 
 
362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  59.38 
 
 
362 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  62.54 
 
 
360 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  53.52 
 
 
360 aa  339  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  59.38 
 
 
362 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  60.76 
 
 
355 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  62.92 
 
 
382 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  53.67 
 
 
359 aa  318  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  53.27 
 
 
343 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  58.18 
 
 
368 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  45.03 
 
 
358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  54.06 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  45.33 
 
 
382 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  49.1 
 
 
385 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  55.17 
 
 
371 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  54.27 
 
 
379 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  48.48 
 
 
369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  51.32 
 
 
360 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  47.32 
 
 
392 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  57.69 
 
 
360 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  46.2 
 
 
386 aa  255  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  43.63 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  40.73 
 
 
377 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  39.76 
 
 
377 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  39.17 
 
 
365 aa  212  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  38.22 
 
 
370 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  38.22 
 
 
365 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  38.22 
 
 
361 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  38.22 
 
 
361 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  41.9 
 
 
368 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  37.26 
 
 
365 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  37.9 
 
 
365 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  36.24 
 
 
366 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  38.78 
 
 
366 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  37.9 
 
 
366 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  37.9 
 
 
366 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  37.9 
 
 
366 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  38.29 
 
 
366 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  37.27 
 
 
366 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  37.27 
 
 
366 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  37.27 
 
 
366 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  36.96 
 
 
366 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  37.27 
 
 
366 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  35.94 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  35.28 
 
 
364 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  36.02 
 
 
366 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  36.02 
 
 
366 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  36.02 
 
 
366 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  40.8 
 
 
378 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  37.66 
 
 
366 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.55 
 
 
363 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  32.84 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  37.1 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  32.44 
 
 
365 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  30.54 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  31.63 
 
 
365 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  31.5 
 
 
382 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  31.31 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  30.58 
 
 
374 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  32.23 
 
 
440 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  23.77 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.03 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  27 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  24.12 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  31.29 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  20.68 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  25.29 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  22.31 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  26.95 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  25.1 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  25.45 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  25.93 
 
 
367 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  22.3 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  21.93 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>