169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2364 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
335 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  50.48 
 
 
335 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  51.69 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  48.31 
 
 
335 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  49.85 
 
 
328 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  46.34 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  46.13 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  48.14 
 
 
332 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  47.76 
 
 
336 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  44.14 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  39.25 
 
 
336 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  39.12 
 
 
336 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  39.41 
 
 
336 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  38.28 
 
 
336 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  39.56 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  37.98 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  37.98 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  40.5 
 
 
330 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  40.36 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  42.12 
 
 
316 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  35.41 
 
 
336 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  38.7 
 
 
365 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  39.18 
 
 
333 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  38.69 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  35.41 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  35.41 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  31.69 
 
 
343 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  30.22 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  29.97 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.05 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  27.31 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.87 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  24.92 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.91 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.25 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.65 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  28.63 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  24.53 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  24.05 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  24.33 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.71 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.1 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  25.29 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.98 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.76 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.05 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  25.57 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.66 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.36 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.72 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  24.79 
 
 
322 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.53 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.59 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.81 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.09 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.4 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  24.91 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.92 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.56 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  23.44 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1267  sodium/calcium exchanger membrane region  22.54 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  32.35 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.71 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.28 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.37 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.28 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  23.87 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.37 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.82 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.11 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.37 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.77 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.38 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.46 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.13 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02649  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.11 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.56 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.49 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.49 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.48 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.28 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.07 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.86 
 
 
367 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.57 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.22 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.81 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.49 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.49 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.78 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  29.41 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0181  sodium/calcium antiporter family protein  24.55 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  25.36 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.5 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.49 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.47 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.79 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.79 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.79 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  24.28 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>